Внутри храма имелся белый высокохудожественный иконостас в 20 икон и настенные росписи, исполненные художником-иконописцем Николаем Степановичем Задорожным с участием брата Петра Степановича Задорожного, также художника-иконописца. Считалось, что с созданием этого иконостаса и росписей в религиозной живописи Харбина появилось новое художественное течение.

Храм располагался в центре поселка на участке площадью в 1500 кв. сажень (6 828 кв. метров). В ограде церкви были флигель для псаломщика и сторожа и два дома общей площадью 74 кв. сажень (337 кв. метров), в одном из которых размещались школы: начальное и высшее начальное училища.

Строительство храма Свято-Николаевской церкви было начато в 1924 году, храм был освящен в 1928 году.

Приход в Затоне был основан в 1923 году. До постройки каменного храма был освящен временный храм в железнодорожной школе. Затем, новая администрация дороги, пришедшая в связи с переходом к совместному управлению дорогой Китаем и СССР, вынудила покинуть железнодорожную школу и год храм находился в наемном помещении. С 1925 года и до освящения в 1928 году нового каменного здания церкви храм размещался в одном из двух купленных приходом домов, в другом были школы.